Сахалинский научно-исследовательский институт рыбного хозяйства и океанографии (СахНИРО) был организован в 1995 году, а в 2014 организация была преобразована в государственное научное учреждение. Основной деятельностью института является проведение исследований и мониторинг состояния промысловых гидробионтов, поверхности дна и донного ландшафта. Специалисты СахНИРО наблюдают за экологической обстановкой прибрежных вод, разрабатывают рекомендации по лечению морских обитателей, создают базы данных. В состав Сахалинского научно-исследовательского института рыбного хозяйства и океанографии входят 6 основных отделов: прогнозирования, обработки и первичного агализа данных, аквакультуры и воспроизводства, экспедиционного обеспечения и прочего. Также на базе института функционируют биостанции и научные пункты на Сахалине, работает издательская группа, выпускающая научный журнал, в котором публикуются научные статьи и рецензии. Институт сотрудничает с рядом российских и зарубежных организаций, в том числе Международной пятисторонней Северо-Тихоокеанской комиссией по анадромным рыбам, Межправительственной научной организацией PICES и Научно-исследовательской организацией Хоккайдо.