ФГБНУ «НИИ аэрокосмического мониторинга «АЭРОКОСМОС» министерства образования и науки РФ под научно-методическим руководством Российской академии наук» сокращенно НИИ «АЭРОКОСМОС» возник 1 декабря 2000 года. Сначала НИИ являлся учебным центром. В 2004 году 18 февраля на базе университета появился научно-образовательный центр, занимающийся проблемами аэрокосмического мониторинга — ЦПАМ «АЭРОКОСМОС». Центр находился под руководством РАН. В 2004 году 25 октября научное учреждение было переименовано. С этого момента оно стало называться ГУ «Научный центр проблем аэрокосмического мониторинга». В 2011 году 31 мая произошло опять переименование научно-исследовательского института. С этого момента его название остается неизменным. Целями НИИ «АЭРОКОСМОС» являются фундаментальные и прикладные исследования с применением аэрокосмических методов и технологий. К тому же НИИ занимается разработкой и реализацией методов, технологий, программ и проектов зондирования на расстоянии, обработки информации, полученной аэрокосмическим путем, контролем чрезвычайных ситуаций, мониторингом окружающей среды и прочим. НИИ «АЭРОКОСМОС» подготавливает научные кадры высшей квалификации и специалистов по новым методам, проводит научные исследования на более высоком уровне, занимается интеграцией науки и образования. НИИ «АЭРОКОСМОС» имеет в своем коллективе известных ученых и высококвалифицированных специалистов.