ЦНИИ организации и информатизации здравоохранения создан в 1999 году. Учреждение ведет деятельность по ряду направлений, среди которых научная работа, информатизация здравоохранения, образовательная деятельность, сотрудничество в международных делах. Важнейшая цель НИИ – разработка основ реализации политики государства в области здравоохранения, научное обоснование путей развития охраны здоровья граждан, организация и информатизация различных процессов в этой сфере. Институт имеет профильные подразделения, решающие самостоятельные задачи. К таким задачам относятся разработка стратегии развития всей системы здравоохранения, выработка практических рекомендаций, методик, программ, нормативов и различных вариантов решений по управлению. Важная часть работы НИИ – организационное и методологическое обеспечение в деле формирования единой системы информатизации в рамках отраслевого министерства. Специалисты Института ведут разработку современных форм организации любых видов медпомощи и методик управления всей системой охраны здоровья. Коллектив участвует в проведении экономических и организационных экспериментов, в подготовке целевых программ. В НИИ проводится широкий спектр социально-гигиенических, медицинских и демографических исследований, в том числе и изучение общественного мнения.