Детская городская больница №2 города Томск осуществляет оказание экстренной неотложной медицинской помощи, а также детской стоматологической помощи на бюджетной основе. В состав больницы входит шесть поликлинических отделений, а также два отделения детской стоматологии. В поликлинических отделениях больницы проводят прием все узкоспециализированные специалисты, а также врачи-педиатры широкого спектра. В больнице действует областная программа по обеспечению социальных гарантий граждан на оказание бесплатной медицинской помощи. Все врачи имеют высший уровень квалификации, прием специалистами производится по записи а также по вызову в порядке закрепленных адресов в регистратурах поликлиник.