Школа «Шамир» начала функционировать в 1989 году при Ленинградской синагоге. В то время это было первое общеобразовательное еврейское учреждение. Инициатором создания школы стал раввин Михаэль Корец, а такую идею подал Герман Брановер (профессор Беер-Шевского университета, глава общества «Шамир» — союза еврейской интеллигенции). Школа успешно обучала и воспитывала детей в стенах синагоги до 1996 года. Потом учебное заведение получило другое здание в Адмиралтейском районе Санкт-Петербурга. В «Шамире» обучаются около ста учеников 4-17 лет. В классах находится не больше 8-10 человек, что позволяет детям добиваться лучших результатов в учебе. Педагоги в работе используют государственные общеобразовательные программы в сочетании с методами традиционного еврейского воспитания. В дополнение к урокам общего стандарта преподается цикл предметов еврейской культуры: иврит, традиции и история еврейского народа. Мальчики и девочки обучаются совместно. В школе «Шамир» блюдут правила Шаббата и Кашрута. В работе учебного заведения много внимания уделяется внеклассной деятельности и дополнительному образованию детей. В стенах школы открыто дошкольное отделение «Ладошки».