НИИ фармакологии был создан при Академии медицинских наук Советского Союза в 1952 году. Долгое время учреждением руководил выдающийся ученый академик В.В. Закусов. С 2012 года Институт получил статус государственного бюджетного учреждения Российской академии медицинских наук. НИИ развивает плодотворное научное сотрудничество с рядом зарубежных университетов и исследовательских центров. Сотрудники Института принимают участие в национальных и всемирных конгрессах, симпозиумах и конференциях по фармакологии. Систематически учреждение организует научные мероприятия с участием ученых из стран СНГ, Германии, Финляндии, Италии, Китая, США. В сфере особых научных интересов коллектива НИИ – проблемы нейропсихофармакологии. Здесь также разрабатываются вопросы, относящиеся к биологическим основам чувствительности человека к психотропным препаратам. В составе учреждения десять фармакологических лабораторных подразделений, имеющих свою собственную специализацию. Главные из них – лаборатория психофармакологии, отдел фармакогенетики, лаборатория радиоизотопных методов исследований, отдел химии лекарственных средств, а также опытно-технический отдел. Общая структура подразделений соответствует технологии последовательного конструирования веществ.