«Городская клиническая больница №31» оказывает амбулаторную и стационарную медпомощь жителям Санкт-Петербурга. Больница выступает базовым учреждением по обслуживанию госслужащих и сотрудников дипкорпуса в городе. «Городская клиническая больница №31» предлагает широкий перечень медицинской помощи, в том числе высокотехнологичной. Консультативно-диагностические и лечебные услуги оказываются в амбулаторных поликлинических и стационарных условиях. Структура стационара «Городской клинической больницы №31» включает отделение хирургии, терапии, кардиологии, неврологии, кардиореанимации, онкологии, гематологии для детей и взрослых (с химиотерапией), гинекологии, физиотерапии и ЛФК, трансплантации почек и костного мозга. Также на базе учреждения функционируют отделения хирургического лечения нарушений сердечного ритма и рентгенохирургических методов. Специализированные подразделения больницы включают кабинеты переливания крови, гемодиализа, гравитационной хирургии. Лабораторно-диагностические подразделения больницы представлены отделением лучевой и радионуклидной диагностики, функциональной и УЗИ-диагностики, КДЛ, лабораториями иммунологии и молекулярной генетики, эндоскопическим и патологоанатомическим отделениями. В составе «Городской клинической больницы №31» функционируют центры по онкогематологии, трансплантации органов, лечению рассеянного склероза, заболеваний кишечника и др.