Городская клиническая больница им. С.П. Боткина является крупным медицинским объединением, мощность которого составляет 2300 койко-мест. Материально-техническая база учреждения позволяет оказывать пациентам многопрофильную специализированную помощь. Высокотехнологичное оборудование и профессионализм врачей обеспечивают качество диагностики и лечения. Все отделения больницы являются клинической базой профильных кафедр ведущих медицинских институтов и университетов российской столицы. В медицинском учреждении сформированы несколько служб: хирургическая, амбулаторная, диагностическая, терапевтическая. В структуру больницы им. Боткина входят три филиала: офтальмологический стационар (на 170 мест), родильный дом (на 120 мест), многопрофильный стационар (на 540 мест). Хирургическая служба представлена отделениями урологии, хирургии, гинекологии, сердечно-сосудистой патологии, травматологии, нейрохирургии, офтальмологии, онкологии, лапароскопической хирургии. В состав амбулаторной службы входит консультативно-диагностическая поликлиника и 6 женских консультаций. Диагностическая служба располагает полномаштабным комплексом оборудования для выполнения различного рода обследований организма. Терапевтическая служба представлена отделениями терапии и пульмонологии, неврологии, кардиологии, психиатрии, радиологии.