Даниловское кладбище было основано в 1771 году по указу императрицы Екатерины II. На следующий же год на территории погоста был построен храм, освященный в честь священномучеников Херсонесских. Современное здание церкви Сошествия Святого Духа на Даниловском кладбище было построено в 1832 году на месте обветшалой деревянной церкви на территории кладбища. Автор проекта – Ф.И. Шестаков. Каменная церковь была освящена 25 сентября 1838 года. Иконостас храма работы 1832 года сохранился и по настоящее время. В 20-е годы XX века из церкви было изъято более 120 кг золотых и серебряных предметов утвари и различных украшений. Однако, этот храм один из немногих, который не был закрыт во время советской власти. В начале 30-х годов прошлого века церковь была захвачена обновленцами, а в 1944 году храм был возвращен Московской Патриархии. В храме находятся святыни, перенесенные сюда из закрытого в 1929 году Симонова монастыря.На Даниловском кладбище находится самое большое число захоронений православного духовенства в Москве. Главные святыни храма: Иверская икона Божией матери, икона «Скоропослушница», мощевик со святыми мощами и икона преподобного Серафима Саровского. При храме работает библиотека и воскресная школа.