Институт минералогии, УрО РАН организован в 1988 году на базе научных подразделений Ильменского государственного заповедника имени В.И. Ленина с целью развития фундаментальных исследования в области минералогии. Институт минералогии УрО РАН, с момента его основания находится на передовых позициях в области наук о Земле. На протяжении 25–летнего существования Института научные исследования его сотрудников были направлены на изучение минералогии важнейших типов рудных месторождений, экспериментальное моделирование магматических и гидротермальных процессов, решение экологических проблем, возникающих в процессах добычи и переработки полезных ископаемых. Институт минералогии – признанный мировой лидер в создании и развитии литолого-минералогической теории колчеданообразования, увязывающей в единую концепцию процессы седиментогенеза, гальмиролиза и биогенеза на колчеданоносных полях современных и древних океанов. В институте разработана теория аффинной гомологии кристаллов; обнаружен новые структурные классы минералов – трифосфаты с цепочечной структурой, силикооксиды, силикохлориды и силикофториды. Выполнены уникальные эксперименты по изучению строения магматических расплавов, а также структурных аналогов силикатов в расплавленном и стеклообразном состоянии, разработана общая теория анионных равновесий в силикатных системах. В 1998 г на базе Института минералогии создан геологический факультет Южно-Уральского Государственного Университета.