Институт проблем экологии и эволюции начал свою деятельность в середине 30-х годов прошедшего столетия. Его базой стала Лаборатория эволюционной морфологии, основанная академиком Северцовым, который и стал первым руководителем данного учреждения. Свое нынешнее наименование Институт получил в 1994 году. Это связано с возросшим значением исследований в области биологического разнообразия, эволюции и экологии. В фокусе внимания специалистов Института находятся проблемы, имеющие отношение к частной и общей экологии животных, их поведению и морфологии, рассматриваемых в эволюционном аспекте. Кроме проведения фундаментальных исследований сотрудники учреждения активно разрабатывают рекомендации по сохранению достигнутого биоразнообразия животного мира и по охране природы. Институт имеет два филиала и более двух десятков научных групп и исследовательских лабораторий, виварий, несколько биологических станций, подразделение электронной микроскопии. Исследовательская деятельность проводится сотрудниками Института в самых разных регионах России. Каждый год Институт публикует несколько десятков книг и сотни статей по теоретическим и практическим проблемам экологии, биологии и эволюции животных.