В 2004 году ФГУП «Госкорпорация по ОрВД» было основано некоммерческое образовательное заведение для дополнительного образования - Институт Аэронавигации. Процесс согласовывался с Федеральным агенством воздушного транспорта Министерства транспорта РФ, институт был основан для лучшей организации повышения квалификации специалистов и профессиональной переподготовки. В настоящее время институт аэронавигации обладает лицензией на право проведения образовательной деятельности и свидетельством (сертификат) соответствия требованиям Воздушного законодательства РФ, и таким же сертификатом для Межгосударственного авиационного комитета. Структура Института Аэронавигации состоит из 12 филиалов, которые находятся в крупных городах России. Также институт имеет собственный учебный центр, на территории которого находятся учебно-тренажерный комплекс и библиотека. Присутствующий на территории научно-образовательный комплекс состоит из координационно-методического центра системы дистанционного обучения и поддержания квалификации, а также кафедры организации воздушного движения и эксплуатации радиотехнического оборудования, административно-управленческой деятельности и языковой подготовки, навигационного обеспечения полетов и аэронавигационной информации.