Гербарий лишайников был образован в 1900 году. В основу Спорового гербария легли коллекции низших растений, собранные известными отечественными ботаниками (Крашенинниковым, Палласом, Потаниным, Пржевальским и др.), а также зарубежные коллекции. В 1963 году гербарий лишайников поступил на хранение в Лабораторию лихенологии и бриологии Ботанического Института им. В.Л. Комарова РАН. В настоящий момент Гербарий лишайников БИНа представляет собой крупнейший в России и один из крупнейших гербариев в мире. В Гербарии хранится более 250 тыс. образцов, включая около 600 типовых образцов названий лишайников. Особый интерес представляют типовые образцы видов, описанных из Арктики, Антарктики, Сибири, Дальнего Востока и Центральной Азии. Структурно лаборатория разделяется на две группы: бриологическую и лихенологическую. Основные исследования лаборатории сосредоточены на флористическом исследовании мохообразных и лишайников России и за ее пределами, а также изучении их анатомии, морфологии, географии, экологии и таксономии.