ОАО «Институт микроэкономики» был создан в 1994 г. путем объединения НИИ Управления, Всесоюзного НИИ топливно-энергетических проблем, Института комплексных транспортных проблем при Госплане СССР. Цель создания единого института заключалась в проведении исследований в направлении микроэкономики, подготовке рекомендаций и предложений для решения экономических и социально-политических вопросов РФ. В настоящее время в вузе проводятся многопрофильные исследования в области экономики с использованием собственных научных и методических разработок. Исследования осуществляются по государственному контракту с федеральными органами власти. Также институт занимается образовательной деятельностью и выпускает специалистов высшей квалификационной категории по специальностям: экономика природопользования, экономика, региональная экономика и др. На территории вуза действует издательский комплекс, который является его собственностью, в нем выпускаются различные монографии в области экономики, а также научно-практический журнал «микроэкономика». За вклад в обеспечение национальной экономики научно-методическими материалами ОАО «Институт микроэкономики» неоднократно награжден грамотами от Минобрнауки и Минэнерго РФ, а также награжден международной премией «Золотая медаль» в 2013 г.