Департамент мелиорации представляет собой подразделение Министерства сельского хозяйства РФ. Он занимается выработкой государственной политики в области мелиорации, а также управляет государственным имуществом, закрепленным за Министерством. Разрабатывает проекты федеральных нормативных актов по направлениям своей деятельности. Также Департамент предлагает для реализации различные программы по мелиорации, разрабатывает меры государственной поддержки сельскохозяйственных производителей в области мелиорации. Занимается Департамент мелиорации и противоэрозийными мероприятиями с целью поддержать плодородность сельскохозяйственных почв. Этим подразделением Министерства ведется учет мелиорированных земель, разрабатываются нормы проведения мелиорации, планируются мероприятия по пропуску половодья и паводков через специальные сооружения. Вместе с Департаментом всем этим занимаются также закрепленные за ним бюджетные учреждения. По результатам проведенной деятельности составляются доклады и отчеты. Также выдвигаются предложения о государственном финансировании тех или иных научных проектов в области мелиорации. Департамент следит за эффективностью работы своих сотрудников, при необходимости осуществляет их профессиональную переподготовку.