Музей истории Санкт-Петербургского университета был создан в 1945 году. Основу его коллекции составили экспонаты выставок, посвященных юбилею университета, которые прошли в 1939 и 1944 годах. В музее проводятся тематические выставки, посвященные жизни вуза и Санкт-Петербурга, а также экспозиции в честь именитых профессоров университета и великих деятелей науки. Среди наиболее масштабных выставок: экспозиция, посвященная истории спортивных состязаний в стенах университета, периоду блокады Ленинграда и страницам университетской жизни того времени. Также в Музее истории СПбГУ проходят экспозиции, посвященные деятельности В. Б. Алесковского, Л. Н. Гумилева, А. Д. Александрова, И. Д. Стрельникова, В. И. Вернадского, А. С. Лаппо- Данилевского.