В состав ГБУЗ «Научно-практический центр медицинской радиологии» входят пять подразделений: научное, практическое, рентгенологическое отделение, учебно-консультативный отдел и испытательная лаборатория. Центр располагается в двух зданиях: главный корпус – на улице Средняя Калитниковская, а учебно-консультативный отдел НПЦМР – на улице Расковой. Основная деятельность учреждения направлена на проведение научно-исследовательских работ, связанных с развитием деятельности службы лучевой диагностики в Москве. Специалисты центра разрабатывают, апробируют и внедряют инновационные технологии лучевой диагностики, проводят опытно-конструкторские работы по созданию специальной рентгенорадиологической аппаратуры и контрольно-измерительного оборудования, занимаются разработкой специализированных информационных систем и т.д. Предметом деятельности организационно-методического отдела Научно-практического центра медицинской радиологии является разработка нормативных документов для служб лучевой диагностики, консультативная помощь в составлении отчетов и консультации по вопросам организации работы. Здесь проводятся курсы повышения квалификации и аттестации врачей и среднего медицинского персонала отделений радиологии, рентгенологии и ультразвуковой диагностики.