ФГБНУ «Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и перинатологии» Сибирского отделения РАМН было открыто в 2002 году в Томске с целью создания научно-практического центра, способного на базе последних научных достижений выработать и осуществить комплекс мероприятий, направленных на оздоровление женщин детородного возраста, снижение мертворождаемости, материнских потерь, смертности и заболеваемости новорожденных. Приоритетным направлением деятельности института является исследование комплексных механизмов нарушения и сохранения здоровья, продления активного периода и повышения качества жизни населения при воздействии неблагоприятных экологических факторов Крайнего Севера, Сибири и Дальнего Востока. На базе учреждения работает ученый совет, школа-семинар для акушеров-гинекологов, биоэтический комитет. В институте имеется 5 отделений: патологии беременности, родильное, новорожденных, гинекологическое, анестезиологии и реанимации, клинико-диагностическое. В 2008 году специалисты ФГБНУ «Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и перинатологии» стали оказывать амбулаторную помощь по следующим направлениям: прием по невынашиванию беременности, наблюдение и лечение женщин с метаболическим синдромом, лечение бесплодия, коррекция климактерического синдрома, подготовка к проведению ЭКО и иным вспомогательным репродуктивным технологиям. В учреждении ведут прием гинекологи-эндокринологи, терапевты, физиотерапевты, диетологи.