НИИ ФХМ был создан в 1981 году как подразделение МОЛГМИ им. Пирогова, а впоследствии преобразован в самостоятельный научно-исследовательский институт Минздрава СССР. В этом учреждении заложены научные основы эфферентной медицины, разработаны практические аспекты псориаза и атеросклероза, начаты исследования иммунодефицитов. В Институте был создан первый в России тимический иммуномодулятор, начаты изыскания в области оксидативного стресса. Учреждение находится в постоянном развитии. На его базе был образован отдел генетики и молекулярной биологии. Теперь это мощное и организованное в соответствии с самыми современными требованиями подразделение, в ведении которого находятся вопросы генетики, клеточной биологии, биоинформатики, генной инженерии. Основная цель деятельности НИИ – внедрение в практику новых методов диагностики, средств профилактической медицины, изучение физико-химических основ патогенеза. Институт проводит комплексные исследования, направленные на изучение физических и химических основ возникновения заболеваний человека. Здесь создаются и получают внедрение оригинальные методы медицинской диагностики, которые основаны на новых данных о закономерностях развития заболеваний. Разрабатываются уникальные методики лечения, позволяющие восстанавливать внутреннюю среду организма.