В настоящее время в НИИ непрерывного педагогического образования исследовательская деятельность проводится в трех отделах. Отдел исследования проблем развития педагогического образования - сотрудниками отдела были систематизированы современные подходы к проектированию образовательного процесса в магистратуре, а также выполнен анализ изменения профессиональной деятельности преподавателя ВУЗа в образовательном процессе магистратуры. Отделом сравнительных исследований в области образования были разработаны концепция и основы организации научно-исследовательской деятельности студентов магистратуры в контексте инновационного развития образования. Разработаны современные программы подготовки будущих педагогов и программы повышения квалификации работающих учителей. В отделе проектирования научно-методического обеспечения педагогического образования разработана система оценки качества профессиональной подготовки бакалавров и магистров в современном ВУЗе на основе компетентностного подхода, учитывающего профессиональные стандарты и требования работодателей. Обоснованы принципы, способы и формы системы оценки качества подготовки бакалавров и магистров. Результаты научных исследований нашли свое отражение в подготовленных рекомендациях как для обучающихся, так и для руководителей структурных подразделений.