НИИССУ имеет статус головного предприятия, разрабатывающего системы полевой связи для военного ведомства России. Институт участвует также в создании ряда иных объектов, включая комплексные системы управления и автоматизации в интересах Министерства обороны и некоторых других российских ведомств. Институт имеет серьезный научно-технический опыт в сфере применения цифровых и информационных технологий, поэтапное внедрение которых обеспечивает создание единого и однородного информационного пространства в области систем управления особого назначения. Разработки НИИ позволяют максимально использовать защищенные компьютерные технологии. Сотрудники учреждения также разрабатывают рекомендации по применению средств вычислительной техники, определяют подходы к проектированию информационного обеспечения. Деятельность НИИССУ основывается на следовании единой технологии и методологии формирования полевых систем связи и автоматизации, которые составляют техническую основу разнообразных систем управления. В разработках Института максимальным образом используются действующие международные и государственные стандарты в части протоколов комплексной защиты информации и телекоммуникационных протоколов.