Днем рождения ЦВ «Протек» считается 21 ноября 1990 года. Несмотря на то, что первый контракт на поставку медикаментов с венгерским партнером «Гедеон Рихтер» был заключен только через два года, зарегистрирована компания была именно в эту дату. До момента сотрудничества с венгерским партнером она занималась в основном информационными технологиями. Заключение именно этого контракта сыграло решающую роль, определив будущее приоритетное направление в развитии предприятия. Через год, в 1993 году в портфеле «Протек» лежали договора уже с четырьмя крупными иностранными фармацевтическими компаниями, а еще через год к ним присоединяются и отечественные производители. В это же время открываются первые филиалы в регионах, а в 1996 году их количество увеличивается до 20-ти. В 1997 году ЦВ «Протек» открывает первый, крупнейший в Восточной Европе склад площадью в 25 000 кв. метров. В 2015 году компания отметила свой 25-летний юбилей успешной деятельности. В её основе лежит совершенно особая комплаенс-политика, принципы которой регламентируют работу в полном соответствии с действующим законодательством и нормами, разработанными самой компанией. Целью комплаенс-политики является поддержание авторитетной репутации и доверия со стороны клиентов, партнеров и сотрудников компании.