Республиканская клиническая больница № 2 представляет собой государственное бюджетное учреждение здравоохранения, которое оказывает первичную, врачебную и доврачебную, специализированную помощь в амбулаторных условиях, а также специализированные медицинские услуги в стационарных условиях. Данное юридическое лицо подведомственно Министерству здравоохранения Республики Башкортостан и Управлению делами Президента Республики Башкортостан. В учреждении проводится прием прикрепленного контингента - должностных лиц и сотрудников органов власти Республики Башкортостан, руководителей ведомств, учреждений и организаций Республики. В больнице успешно работает Башкирский республиканский центр телемедицины, который повышает уровень медицинского обслуживания, внедряя методы дистанционного оказания медицинской помощи и обмена специализированными данными на основе современных технологий. Благодаря применению телемедицинских технологий Республиканская клиническая больница № 2 проводит телеконсультации с ведущими специалистами России и всего мира; организует видеолекции и видеоконференции, позволяет получать современные методики для практики врачей республики.