Факультет логистики и транспорта существует с 1974 года. Изначально он назывался факультет автомобильного транспорта. Основатель факультета Виктор Щетинин стал первым же деканом. В настоящее время здесь обучаются около 1500 студентов. Из них на очной форме обучения состоят 860 студентов, 540 - на заочной и очно-заочной, еще 25 учатся в магистратуре. Преподавательский состав факультета составляют около 70 сотрудников. При этом 69% из них состоят в штате, у 71% есть ученые степени и звания. В рамках специалитета студентов обучают по программе "Таможенное дело". На бакалавриате обучают по следующим направлениям: "логистика", "Производственный менеджмент", "Экономика предприятий и организация (транспорт)". На магистратуре также действуют несколько программ: "Логистика", "Международный менеджмент мультимодальных перевозок", «Менеджмент таможенных услуг».