Основной задачей Специальной Астрофизической Обсерватории РАН, СПб. Филиала является проведение методических, наблюдательных и астрофизических работ на специальном радиотелескопе с рефлекторным зеркалом диаметром около 600 метров (РАТАН-600). Основными направлениями научных исследований компании является выполнение фундаментальных астрофизических исследований ближнего и дальнего космоса радиоастрономическими методами, в частности: радиоизлучение Солнца и планет; радиоизлучение Галактики; метагалактическое радиоизлучение; инструментальное, методическое и технологическое сопровождение уникального радиотелескопа РАТАН-600; развитие методов радиоастрономических наблюдений; разработка и внедрение приемной радиоастрономической аппаратуры.