Клиника №2 МНПЦ борьбы с туберкулезом – самостоятельное структурное подразделение, включающее в себя комплекс клинических, диагностических, лечебных отделений и несколько вспомогательных служб. Главное направление деятельности больницы – оказание плановой и экстренной помощи в области хирургии, гинекологии, кардиологии, урологии и прочих видов сопровождения больных с самыми разными локализациями туберкулеза, а также с ВИЧ-инфекцией. Учреждение имеет в своем составе современное приемное отделение, отделения фтизиопульмонологии и общей хирургии, интенсивной терапии и реанимации. Здесь имеются также и другие подразделения, где оказывают врачебную помощь в области педиатрии, торальной хирургии, офтальмологии, нефрологии, акушерства и гинекологии. Консультативно-диагностический центр больницы укомплектован специалистами высокой квалификации, которые имеют опыт в лечении внелегочного туберкулеза. На базе структурного подразделения работает самостоятельное педиатрическое отделение. Вспомогательные подразделения больницы включают отделения рентгенологии, функциональных, эндоскопических и ультразвуковых методов исследования, трансфузиологии, физиотерапии, а также гравитационной хирургии крови. В распоряжении специалистов – микробиологическая, клиническая и патоморфологическая лаборатории. Клиника является научной базой для ряда крупных научно-исследовательских и образовательных учреждений медицинского профиля.