Всероссийский НИИ экспериментальной ветеринарии им. Я.Р. Коваленко занимается разработкой методов, средств и фундаментальных основ диагностики, профилактики и лечения самых распространенных массовых болезней различных животных, в том числе тех болезней, которые считаются общими для животных и человека. Для этого сотрудниками института в лабораториях используются методы клеточной биотехнологии и генной инженерии. Также в сферу деятельности института входит определение этиологической структуры болезней молодняка, как желудочно-кишечных, так и респираторных, разработка и расширение методов диагностики, терапии и профилактики. На основе разработок создаются новые поколения препаратов, диагностических и вакцинных, изучаются генетические и биологический свойства штаммов микроорганизмов. Институтом разработано и предложено к внедрению в ветеринарную практику вакцин, антигенов, сывороток, аллергенов — более 70, также более 200 новых методов лабораторной диагностики инфекционных и протозойных болезней животных, пчел и рыб. Авторскими свидетельствами защищено более 250 разработок, более 80 защищено патентами. Кроме того, 25 патентов зарегистрировано за рубежом. За разработки инженеры института удостаивались 6 Государственных премий СССР и 3 премии правительства РФ.