Японский центр в Санкт-Петербурге организован в 2001 году в качестве филиала АНО «Японский центр», центральный офис которого находится в столице России. Всего в стране имеется семь подобных центров. Их работа строится в соответствии с соглашениями, заключенными между правительствами Японии и России. Задача Центра – организация обучения руководителей предприятий и бизнесменов. Обучение проводят командируемые из Японии специалисты. В ходе лекционных занятий слушатели приобретают знания в областях, связанных с переходом России к рыночной экономике. Круг рассматриваемых вопросов достаточно широк: маркетинг, управление предприятием и финансами, внешняя торговля, финансовый учет и контроль. Кроме этого Центр занимается организацией обучения японскому языку, проводит семинары и культурные мероприятия. Для слушателей, успешно прошедших подготовку, организуются стажировки в Японии. При Центре работает библиотека с читальным залом, которая открыта для общего доступа. Здесь имеется литература на японском, английском и русском языках, включая учебные тексты. В учреждении слушатели Центра могут получить доступ к самой свежей информации, имеющей отношение к мировой экономике. Сотрудники Центра систематически работают над расширением спектра оказываемых услуг.